O Departamento de Física é uma instituição de investigação, com actividade científica de relevo em vários domínios do saber. A investigação desenvolve-se integrada em Centros e Unidades de Investigação reconhecidos pela Fundação para a Ciência e a Tecnologia (FCT), os quais são regularmente avaliados por paineis de avaliação independentes, nomeados pela FCT. Na última avaliação publicada pela FCT as unidades de investigação sedeadas no Departamento de Física foram classificadas com classificações de "Excelente" (1), "Muito Bom" (3). Este resultado é um indicador da qualidade da investigação desenvolvida no Departamento de Física.

Para informação acerca dos projectos de investigação em curso, as colaborações internationais, as publicações, ou sobre os aspectos organizacionais de cada unidade por favor consulte os respectivos sites, listados a seguir.